Sí, el Atmosphere es gratuito, solo tienes que copiar los archivos de Atmosphere y los sigpatches en la SD y arrancar con el payload fusee-primary.bin usando tegraRcmGui
Yo inicio la switch con la última versión de Atmosphere + sigpatches sin problemas. Acuérdate de usar también el nuevo fuse-primary.bin. Además dejado el boot.dat en la misma SD por si la gente de sx os soluciona el problema en el futuro.
El boot.dat tiene que ir en la raíz de la SD y debería arrancarte sin problema pero después tendrás que actualizar el firmware de la switch a la versión 11.0.0 con ChoiDujourNX
Copia el boot.dat de la version 3.1.0 para actualizar el sx os a la ultima versión y después actualiza el firmware de la switch a la version 11.0.0 usando DayBreak o ChoiDujourNX. Ten cuidado porque la version 11.0.1 no funciona con sx os. Actualiza a la 11.0.0.
Podéis tener Atmosphere también en la SD y arrancando con el fusee-primary podes arrancar la versión 11.0.1 sin problemas. Si el sx os soluciona en un futuro el problema con la version 11.0.1 entonces podréis usar de nuevo el arranque con dicho sistema
con sx os no funciona la version 11.0.1 a día de hoy pero con Atmosphere va sin problemas. Puedes tener los dos sistemas en la SD sin problemas por si se soluciona para el sx os en un futuro...
Efectivamente primero actualiza Atmosphere y los sigpatches. Yo usé la última versión de choidujourNX y de Atmosphere para actualizar y ningún problema.
Parece que tu problema es conocido. Mira el siguiente enlace:
Fatal error ocurred when running Atmosphére #010041544d530000 · Issue #813 · Atmosphere-NX/Atmosphere · GitHub
Puedes instalar Atmosphere sin problemas manteniendo el boot.dat y el license.dat de SX Pro. Antes de nada haz un backup a la SD para no perder nada y después copia los ficheros de Atmosphere y los sigpatches a la SD y arranca la switch con el fuse-primary.bin
Yo lo tengo así, es decir, en el emuMMC actualizado a la última version 11.0.1 con Atmosphere y en sysnand también actualizado a la última versión para jugar online.