Hola @Lucariovgc31,
Te recomiendo que vuelvas a empezar, borra todas las carpetas de la microSD excepto la de "Nintendo" y descarga el Pack CFW Atmosphère:
https://switchscene.org/resources/pack-cfw-atmosph%C3%A8re.90/
Y vuelve a instalar el CFW y vuelve a probar a instalar el firmware a ver...