Trata de buscar otra versión de hekate y atmosphere para la versión de tu sistema de la nintendo me pasó algo parecido y simplemente era buscar otros archivos
Simplemente dale a iniciar el programa y si quieres que no te moleste debes ingresar a el apartado de gestión de datos o consola no recuerdo bien pero ahí desactivas las actualizaciones automáticas así no te lo pedirá