Lo unico que se ocurre es que formatees la tarjeta micro sd y que pruebes a copiar los archivos de la version 11.0.1 de atmosphere vamos empezar desde cero es una putada pero igual te soluciona el problema mejor eso que tenerla ahi como un pisa papeles
buenas que sepais que han sacado una actualizacion nueva y le he dado a actualizar sin querer estoy en atmosphere espero que saqueis pronto un cfw por favor