¡Buenas!
Para gestionar los arranques de cada partición es imperativo que tengas acceso a Hekate con cada boot. Desde EmuMMC es sencillo pues simplemente puedes ejectar la app
Reboot to Payload y ya vuelves a Hekate, para una vez allí, iniciar el firmware oficial.
El problema es si estás en firmware oficial (sysnand) y quieres cambiar a emunand. Ahí sí que tienes que forzar la consola al modo recovery cada vez que lo quieras hacer.
No es fiable al 100% ya que de alguna manera u otra podrías ensuciar la nand, quemar efuses y dejar la consola vulnerable a baneo de Nintendo.
Por otra parte, yo lo he tenido así durante dos años y nunca he tenido problema, pues siempre lo he hecho con cuidado.
Como consejo, te propongo dos cosas:
1. Obtén dos consolas:
- Una para custom firmare
- Otra para firmware oficial
2. Si solo usas una con OFW y EMUmmc, asegúrate de actualizar AMBAS versiones
SOLO CUANDO EXISTA ACTUALIZACIÓN DE ATMOSPHÈRE Y CFW DISPONIBLE.
Es decir, actualiza el firmware oficial de manera usual única y exclusivamente cuando ya haya una versión de Atmosphère, Sigpatches, Hekate y demás disponible con la misma versión que tenga Nintendo en sus servidores.
No va a pasar nada per ser si no haces esto, pero así te aseguras de no quemar efuses de más, aunque si lo haces de manera oficial, no debería de dar problema ya que se haría de forma legítima (aunque luego tendrías problemas para entrar en la emunand).
¡Suerte!